Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTRF1LQ9UGC7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms