Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEW3

MARCO, Macrophage receptor MARCO, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCOQ9UEW3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCOQ9UEW3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCOQ9UEW3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms