Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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