Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms