Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG4Q9UBN1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms