Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms