Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD2Q9UBB5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms