Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms