Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
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