Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms