Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms