Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms