Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD3Q9NYL9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms