Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC10Q9NYD6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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