Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAH9Q9NYC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAH9Q9NYC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms