Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms