Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDAP2Q9NXN4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms