Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR4AQ9NXH8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms