Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT57Q9NWB7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms