Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PANK4Q9NVE7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PANK4Q9NVE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms