Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM30AQ9NV96 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms