Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms