Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG3Q9NT62 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATG3Q9NT62 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms