Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms