Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms