Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms