Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNNM1Q9NRU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms