Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST12Q9NRB3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms