Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPHK2Q9NRA0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK2Q9NRA0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms