Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF3Q9NR81 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms