Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM8Q9NQV8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms