Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTAC1Q9NQ79 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms