Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms