Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms