Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MID1IP1Q9NPA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MID1IP1Q9NPA3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms