Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRMS1Q9HCU9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms