Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL44Q9H9J2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL44Q9H9J2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL44Q9H9J2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL44Q9H9J2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL44Q9H9J2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL44Q9H9J2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL44Q9H9J2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL44Q9H9J2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL44Q9H9J2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL44Q9H9J2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms