Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKRIP1Q9H875 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRKRIP1Q9H875 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms