Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms