Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms