Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STN1Q9H668 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STN1Q9H668 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms