Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NXF3Q9H4D5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms