Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms