Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms