Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms