Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms