Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM3Q9BZQ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms