Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUF2Q9BZD4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUF2Q9BZD4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms