Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms