Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms